上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身“伯特利医院”创建于1920年。1952年更名为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院（以下简称“九院”），2005年上海第二医科大学与上海交通大学正式合并，九院改名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。

上海二医大附属第九人民医院是一所以口腔、整复外科和骨科为特色的内、外、妇、儿各科齐全的三级甲等综合性教学医院。近年来，以“精修医术、诚炼医德、广纳贤才、齐铸九院”的医院精神，以“科教兴院、人才强院”的发展战略，在医、教、研、管理等方面取得了可喜成绩。已连续八届评为上海市文明单位，并获“全国城市医院文化建设先进集体”荣誉称号。

上海二医大附属第九人民医院占地面积61亩。医院核定床位1000张，口腔综合椅位260张。全院职工2285人。   

上海二医大附属第九人民医院拥有3个上海临床医学中心（口腔临床、整复外科、关节外科）和2个上海临床医疗质量控制中心（口腔医学、医学美容）。口腔临床医学、整复外科与组织工程学、外科学（骨科）现为国家重点学科，口腔基础医学现为国家重点培育学科。口腔医学、整复外科学、骨科学为教育部第三期“211工程”重点建设学科。口腔黏膜病科列为国家中医药管理局重点专科。组织工程学为上海市“重中之重“学科，口腔颌面外科为上海重点学科（优势学科），口腔修复生物材料学为上海重点学科（特色学科），口腔基础医学和眼科学为上海第三期重点学科，骨科为上海教委重点学科。眼科、麻醉科、泌尿外科、内分泌科为上海交通大学医学院重点学科。也是上海交通大学医学院血管病诊治中心、疝与腹壁外科疾病诊治中心单位。

上海二医大附属第九人民医院坚持“以人为本”，从广大职工利益出发。医院将着力推进公益性办院发展方向，进一步提高医疗服务内涵和服务管理水平，着力推进 “科教兴院、人才强院”发展思路， 进一步加快医院重点学科和拔尖人才建设，将深入贯彻落实科学发展观，坚定不移地按照党中央、国务院部署要求，在市委、市政府领导下，坚持公共医疗卫生的公益性质，办好“群众放心、人民满意、具有鲜明特色”的现代化医院。

上海二医大附属第九人民医院整形激光美容中心拥有先进的医疗设备，能开展整形外科学范围内的所有手术，是国内较大整形美容医院。