昆明市第三人民医院成立于1954年，前身为“昆明市传染病医院”，1986年更名为昆明市第三人民医院，2003年与“昆明市结核病防治院”合并，成为西南地区规模最大的传染病专科医院，2016年3月通过“三级甲等传染病专科医院”评审，是“云南省传染病临床医学中心”和“昆明市传染性疾病医疗质量控制中心”，2023年3月正式授牌成为国家感染性疾病临床医学研究中心云南省分中心和国家传染病临床医学中心精准医疗与转化医学中心，2023年6月成为国家传染病医学中心感染性疾病专科联盟的常务理事单位，是昆明市政府举办的以传染性疾病诊治为重点，集医疗、教学、科研、社区卫生服务为一体的大型综合性传染病专科医院。医院是大理大学第六附属医院、昆明医科大学临床教学医院。​昆明市第三人民医院设有中西医结合结核病科、耐药与重症结核病科、综合结核病科、介入结核科、结核病临床检验中心、肝病综合科、肝病介入科、肝病免疫科、肝病消化科、性病与艾滋病科、感染性疾病及儿童传染科、重症医学科、关怀科、肿瘤科、骨科、普外科、胸外科、妇产科、麻醉科、呼吸与危重症医学科、心内科、内分泌科、综合内科、血液净化中心、介入导管室、预防保健与慢病管理中心、体检中心、检验科、医学影像科、超声功能科、药学部、公共实验室暨新发传染病研究部、营养科等临床及医技辅助科室。​昆明市第三人民医院的皮肤美容科是一支年轻、团结、务实、勤奋、进取的医疗团队，科室具有温馨、舒适、整洁的医疗环境，一流的医疗设备，可开展常见、疑难皮肤疾病的诊断及治疗，包括：带状疱疹、单纯疱疹、荨麻疹、银屑病、湿疹、激素依赖性皮炎、药物性皮炎、脂溢性皮炎、痤疮、脱发、多形红斑、过敏性紫癜、足癣、甲癣、皮肌炎、硬红斑、系统性红斑狼疮、结节性红斑、下肢血管炎。专科性病：生殖器疱疹、淋球菌、支原体、衣原体相关尿路感染，梅毒，尖锐湿疣等疾病治疗均具有丰富的经验。同时开展注射（进行除皱、瘦脸、瘦肩、瘦腿），水光注射、微针治疗及穴位埋线进行减肥和治疗过敏性疾病。